Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms