Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Rnf180Q3U827 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Rnf180Q3U827 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Rnf180Q3U827 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Rnf180Q3U827 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf180Q3U827 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Rnf180Q3U827 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Rnf180Q3U827 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf180Q3U827 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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