Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U6N9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U6N9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U6N9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U6N9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U6N9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms