Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ulk3Q3U3Q1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms