Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms