Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Hbq1bQ3U0A6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Hbq1bQ3U0A6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Hbq1bQ3U0A6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Hbq1bQ3U0A6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Hbq1bQ3U0A6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Hbq1bQ3U0A6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Hbq1bQ3U0A6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Hbq1bQ3U0A6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hbq1bQ3U0A6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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