Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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