Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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