Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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