Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XylbQ3TNA1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms