Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR2

Xlr4c, X-linked lymphocyte-regulated 4C, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4cQ3TKR2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms