Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms