Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms