Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ccbe1Q3MI99 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ccbe1Q3MI99 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ccbe1Q3MI99 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ccbe1Q3MI99 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ccbe1Q3MI99 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ccbe1Q3MI99 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ccbe1Q3MI99 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ccbe1Q3MI99 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ccbe1Q3MI99 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ccbe1Q3MI99 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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