Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms