Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms