Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Fam178bQ24JP3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fam178bQ24JP3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam178bQ24JP3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam178bQ24JP3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam178bQ24JP3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam178bQ24JP3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam178bQ24JP3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam178bQ24JP3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam178bQ24JP3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam178bQ24JP3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms