Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms