Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fgfbp3Q1HCM0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fgfbp3Q1HCM0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Fgfbp3Q1HCM0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Fgfbp3Q1HCM0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Fgfbp3Q1HCM0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms