Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Perm1Q149B8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Perm1Q149B8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Perm1Q149B8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Perm1Q149B8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Perm1Q149B8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms