Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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VgfQ0VGU4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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VgfQ0VGU4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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VgfQ0VGU4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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VgfQ0VGU4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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VgfQ0VGU4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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VgfQ0VGU4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VgfQ0VGU4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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VgfQ0VGU4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VgfQ0VGU4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VgfQ0VGU4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VgfQ0VGU4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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VgfQ0VGU4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VgfQ0VGU4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VgfQ0VGU4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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VgfQ0VGU4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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VgfQ0VGU4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VgfQ0VGU4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VgfQ0VGU4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VgfQ0VGU4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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VgfQ0VGU4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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VgfQ0VGU4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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VgfQ0VGU4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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VgfQ0VGU4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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VgfQ0VGU4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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VgfQ0VGU4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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VgfQ0VGU4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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VgfQ0VGU4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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