Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms