Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms