Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms