Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBB0

Prelid2, PRELI domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid2Q0VBB0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prelid2Q0VBB0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms