Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115 ms