Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms