Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms