Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms