Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms