Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn2Q08093 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms