Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col17a1Q07563 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms