Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms