Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms