Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Prrx2Q06348 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Prrx2Q06348 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Prrx2Q06348 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Prrx2Q06348 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Prrx2Q06348 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Prrx2Q06348 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Prrx2Q06348 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Prrx2Q06348 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Prrx2Q06348 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Prrx2Q06348 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Prrx2Q06348 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Prrx2Q06348 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Prrx2Q06348 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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