Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms