Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms