Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk18Q04899 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms