Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms