Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top1Q04750 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top1Q04750 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top1Q04750 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top1Q04750 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top1Q04750 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top1Q04750 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top1Q04750 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top1Q04750 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top1Q04750 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms