Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms