Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Nf1Q04690 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Nf1Q04690 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Nf1Q04690 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Nf1Q04690 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Nf1Q04690 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Nf1Q04690 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Nf1Q04690 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Nf1Q04690 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Nf1Q04690 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Nf1Q04690 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Nf1Q04690 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Nf1Q04690 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Nf1Q04690 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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