Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CkbQ04447 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CkbQ04447 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CkbQ04447 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CkbQ04447 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CkbQ04447 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CkbQ04447 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms