Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms