Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha4Q03137 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epha4Q03137 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epha4Q03137 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms