Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1sQ02789 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms