Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms