Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms