Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme2Q01768 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms