Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2aQ01320 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms